Superbactéries critiques à l'époque du COVID-19: le même vieil ennemi?

La propagation du SRAS-CoV-2, l'agent étiologique de la maladie causée par le coronavirus 2019 (COVID-19), a influencé notre approche de la résistance aux antimicrobiens de diverses manières.

Premièrement, les hôpitaux - débordés lors des premiers pics pandémiques - peuvent avoir réduit par inadvertance l'intensité et la qualité des mesures de contrôle des infections et des pratiques de gérance antibiotique, principalement en raison de l'utilisation d'équipements de protection individuelle (le fait d’avoir assisté plusieurs patients COVID-19 en portant le même équipement de protection peut avoir conduit à négliger le potentiel de transmission croisée des superbactéries). Un autre facteur qui a pu y contribuer est que tous les spécialistes du contrôle des infections et des maladies infectieuses ont été réaffectés aux soins d'urgence généraux des patients COVID-19. ^{(1, 2)} Une autre question critique est que lorsqu'une radiographie pulmonaire ou une tomodensitométrie est effectuée, certaines lésions pulmonaires dues à une maladie virale peuvent ressembler à celles d'une pneumonie bactérienne. En conséquence, les médecins peuvent initier un traitement antibactérien inutile chez de nombreux patients, ce qui contribue à son tour au risque de sélection des bactéries résistantes ^{(3, 4)}.

Conformément à ces scénarios théoriques, des épidémies de Klebsiella pneumoniae productrice de carbapénémase (KPC), d'entérocoques résistants à la vancomycine et de Pseudomonas aeruginosa résistant aux carbapénèmes ont été signalées chez les patients les plus graves admis avec COVID-19. ^(5-7)

La solution optimale à ce nouveau défi de la résistance aux antimicrobiens n'est peut-être pas simple à trouver. À notre avis, la première prémisse essentielle à considérer afin d'assurer un succès ultime est que, dans le domaine de la résistance aux antimicrobiens, nous ne combattons plus le même vieil ennemi. Les exigences en matière de contrôle des infections ainsi que l'utilisation d'antimicrobiens chez les patients atteints de COVID-19 peuvent différer de celles d'avant la pandémie et nous devons donc accorder plus d'attention à la manière dont les infections résistantes sont prévenues. Nous devons certainement améliorer notre capacité à diagnostiquer les co-infections bactériennes et les surinfections chez les patients atteints de COVID-19 modéré à sévère grâce à l'utilisation rationnelle et opportune de diagnostics phénotypiques et moléculaires rapides (pour détecter rapidement à la fois les agents étiologiques et les déterminants de la résistance). Cela permettrait d'identifier un sous-groupe spécifique de patients qui pourraient bénéficier d'un traitement antibiotique précoce, conformément aux principes de la médecine personnalisée. De plus, les résultats des tests rapides peuvent également permettre une désescalade rapide si aucun mécanisme de résistance n'est détecté. Il est important de noter que l'ensemble de ces concepts s'applique également à l'approche thérapeutique des surinfections non pulmonaires chez les patients COVID-19 gravement malades, comme les bactériémies, qui pourraient toucher jusqu'à 50% des patients COVID-19 dans les unités de réanimation lors d'une hospitalisation prolongée ⁽⁸⁾.

En particulier, les surinfections chez les patients gravement atteints de COVID-19 peuvent être difficiles à reconnaître en raison de l'atténuation possible des symptômes systémiques et des marqueurs inflammatoires de laboratoire par les agents immunomodulateurs utilisés pour contrer une réponse exagérée de l'hôte à la maladie virale. À son tour, cela peut produire deux conséquences dangereuses qui s'opposent, mais ne s'excluent pas mutuellement: d'une part, la reconnaissance tardive d'une infection bactérienne grave, ce qui implique des retards dangereux dans le traitement antibactérien, susceptibles d'affecter négativement les résultats pour le patient et, d'autre part, l'utilisation généralisée et inappropriée de traitements avec des agents antimicrobiens appliqués à plusieurs patients ne présentant que des symptômes bénins, motivés par la peur de ne pas reconnaître rapidement des processus infectieux systémiques dangereux.

Heureusement, ces possibles scénarios ont commencé à être bien reconnus par la communauté médicale et des contre-mesures dédiées commencent à être adoptées pour contrer efficacement ce nouveau visage alarmant d'un vieil ennemi ennuyeux. Nous ne devons pas baisser la garde.

Écrit par Daniele Roberto Giacobbe, professeur adjoint de Maladies Infectieuses (Université de Gênes)

MC-ID-33-2022